本基金會於84年5月6日經南投縣政府核准，並經地方法院法人設立登記為『財團法人國立南投高商教育基金會』。本會設立基金共新台幣250萬元，由在校師生、歷屆校友、社會善心人士熱心捐助。以教育基金來幫助弱勢家庭學生，促進學生敦品勵學，提昇教育品質，協助校務發展為宗旨。